影片前半部描写韦小宝与神龙教主之间从原来互相敌对变成大被同眠的有趣经过，后半部则描写康熙皇帝将御妹建宁公主赐婚给一方之霸的吴三桂之子吴应熊，韦小宝奉命护送出嫁，使他备感苦恼。

怀玉公主是清朝将领傅正意外收养的一名女孩，其真实身份是明朝亡国皇帝永历之女。在怀玉十八岁的那个元宵节，她和嫂子成莹女扮男装上街出游，竟然邂逅了吴三桂之子吴应熊和微服出巡的康熙皇帝，三个人虽都掩藏了真实身份却十分投缘当即结拜为"兄弟"。一次意外，怀玉与当时显赫的成家结下恩怨，其女子的身份也被康熙知道，三人的关系由此发生了改变。怀玉不可告人的身世之谜、吴应熊和康熙日后的决裂、三人剪不断理还乱的感情纠葛、成家与傅家的恩怨情仇等都成为本剧的看点。