在这个故事里，濑户内海并非地名，而是大阪某男子高中二年级两个男生的名字。濑户小吉身形瘦弱高挑，他曾是足球部的一员，但因和前辈关系不睦而退出社团。内海想文质彬彬，沉默寡言，却也并非只知道读书的书呆子。不知为何，这两个看起来完全没有交集的“回家部”成了朋友。每当下午放学后，他们便相约来到河边坐下。在内海去补习班前的这段时间里，两个人便海阔天空地闲聊起来。他们的话题无所不包，却又无聊空洞。当那个妖精一般的女孩樫村一期出现时，不经意间在木讷的大男孩心间激起波澜……

《你好，昨天》围绕五个家庭展开，以90年代的小吉街为背景，讲述两代人在平凡琐碎的生活中相互扶持、共同成长，最终收获亲情、友情、爱情的暖心故事。故事的主人公是一群生活在小吉街上的少男少女，在那个还没有被淘宝、微博、朋友圈支配的年代，他们有健力宝、大富翁、魂斗罗，有一群坦诚相待的小伙伴，嬉笑打闹奔跑追逐，有福同享有难同当，一起经历着短暂又美好的青春时光，然后各自悄悄长大。