蓝海医院院长周霖面对日益严重的医患矛盾，感觉有些倦意，尤其是蓝海医院被定为医疗改革试点单位后，更觉得力不从心，卫生厅刘会计遭人谋杀，巨额回扣款丢失又将他卷入漩涡。令周霖欣慰的是两个得意门生：冷傲孤寂的李卫国，临床经验丰富，手术干净利落，外号“小李飞刀”；热情开朗的陆一鸣，剑桥学成归来，满怀抱负，锐意改革。面对医改这个重大课题，是进行手术还是保守疗法，两位老同学的分歧暴露出来。加之平日面对安乐死、艾滋病、江湖游医等这些新鲜而非常的个案，两人的矛盾日渐激化。

正走在大街上的女子突然晕倒，让旁边的丈夫不知所措，送往医院救治结果被医生判断为因中风导致的脑死亡。就在刚刚被公布妻子死讯的消息后，医院又开始着手器官移植，妻子的肝脏与正在等待救命的其他病人匹配，丈夫在这样的情况下只好签署器官捐赠协议。医院在肝脏运输、移植的过程中在做着争分夺秒的努力。生命线用另一种方式存在……