明朝初始，政局不稳。卢惟龚凭借老谋深算及超高的智慧，官拜承相，并想进一步控制当今皇上。刚直不阿的军师徐伯明识破其野心，与之展开机智的较量。卢惟龚明里忠诚、可靠，暗地里却勾结王爷，伤害无辜。徐伯明欲追查此事，找出幕后之人。卢惟龚利用徐伯明的师妹阿玥真诚、率直的性格套出内情，在最后一刻逃出包围，未被徐伯明识破其真实身份。其后，卢惟龚又利用皇上与前朝公主兰芳的一段情缘大做文章，离间皇上皇后的关系，并与王爷狼狈为奸，扰乱朝政、陷害忠良、欺压百姓。徐伯明运用智慧在皇后的大力支持取得了最终的胜利。不甘失败的卢惟龚将自

故事发生以明朝正德年间，陕西省宝鸡府凤翔县。世袭指挥秦昆鹏的母亲给孙玉凤送去一只玉镯，孙玉凤回赠一幅荷花图，两家定亲。尤彩凤的舅父母褚生和贾氏夜宿尤家，双双被害，贾氏人头也不知去向。尚朝奉夜拾包袱，见是女人头颅，丢入朱砂井中。他害怕伙计孙玉秀报官，将他推入井中害死。第二天到县衙告状，谎说孙玉秀偷银窃物后逃走。县令钱树于受书吏任义操纵，判孙玉秀的父亲孙国安赔偿，孙国安不服，被押进监牢。孙玉凤父亲被押，上堂辩理，钱树青说她无理取闹，将她押在狱中。女牢中，龙彩凤细说原委，秦昆鹏的未婚妻孙玉凤见此案有冤，决心去府

《怪才军师》是中国大陆的一部喜剧，共31集，改良后有50集。故事讲述了一场异度空间里的明朝（皇帝姓马，皇后姓朱）初期跌宕起伏的宫廷斗争！军师诚意伯徐伯明（对应刘伯温）与丞相卢惟（对应胡惟庸）之间的次终极较量！