故事讲述了上古神魔大战后，神王用炼妖炉、天晶剑、神农尺封印魔神破天，将其囚禁于炼狱枯井，将三神器分别传于墨月族、玄武族、和修仙院分别掌管，并交代三族之长神器不可共同出世，千年后，神王陨落，玄武一族

本片以上古神话人物神农为故事背景，以寻找神农宝盒为线，用科学的态度诠释神话传说，讲述了身为普通人的姜城子，突然有一天变成身兼拯救人类的重大历史使命的角色，面对着强大的邪恶反派木风尘及其异人部族，姜城子由一开始受限于自身狭窄的眼界与格局，渐渐成长为牺牲自己守护世界的英雄形象，面对着前路未知的艰辛与危险，在众人齐心协力的帮助下历经千辛万苦勇于向前与反派斗争到底，最终汇集众人智慧与力量战胜反派解除人类危机的故事。

隋唐时期，小男孩麦冬出生于亳州谯县（今谯城区，唐朝开始便有亳州之名），家中开了一个药铺。因全城突发瘟疫，麦冬向华佗神像祈祷，求得能治瘟疫的灵药，机缘巧合之下却结识了既是花神也是药灵的芍药仙子，并误食华佗祖师的神农仙方。为了弥补过错，麦冬和芍药仙子受命重制神农仙方，不过，这药方却寻之不易，因为方上一共18味中药，却不能拿寻常药材来做，必须寻访各味中药的生长地，找出药灵，说服它们自愿献出药气，才能有效。于是，麦冬和芍药背起行囊，翻山越岭，凭着自己家传医道，四处搜集药灵。

最美村花被逼跟村里的痞子领证，背后暗藏另一个村花的毒蝎之心！